與白河院政時(shí)期不同，鳥羽上皇無意抑制莊園擴(kuò)大，各地武將、豪族、有實(shí)力之人乃至國守等，在全國建立了許多新的莊園，并發(fā)生了許多糾紛?！氨Ｔ畞y”平定后，后白河天皇為了鞏固皇權(quán)，恢復(fù)朝廷權(quán)威，于保元元年（1156）閏九月頒布《保元新制》?！侗Ｔ轮啤沸麚P(yáng)了全國土地都?xì)w天皇支配的王土思想，其主要內(nèi)容為嚴(yán)厲整頓莊園，其主要目的是要將莊園、公領(lǐng)全都掌握在皇室手中。為了籌劃和運(yùn)作新政，后白河天皇將親信信西當(dāng)作經(jīng)世之才，對(duì)他寄予厚望，賦予他很大的權(quán)力。
信西是其于天養(yǎng)元年（1144）出家后取的名字，原名為藤原通憲，是藤原南家的末裔。信西的父親藤原實(shí)兼在擔(dān)任藏人一職時(shí)猝死，之后他成為親戚高階經(jīng)敏的養(yǎng)子，改姓高階。信西的正妻為高階重仲之女，之后又娶了藤原朝子，即后白河天皇的乳母紀(jì)伊局，這為他后來成為后白河天皇的寵臣奠定了基礎(chǔ)。信西曾擔(dān)任鳥羽上皇的院司（判官代），但在當(dāng)上少納言后便放棄了宮廷中的晉升，在出家后取法名為信西。信西博學(xué)多才，精明強(qiáng)干，曾受鳥羽上皇之命，編纂以接續(xù)六國史為目的的史書《本朝世紀(jì)》，并編纂了收錄各項(xiàng)法令及歷代明法家們見解和經(jīng)典判例的《法曹類林》，是當(dāng)時(shí)著名的學(xué)者。
信西在后白河天皇的支持下，不斷推出各種新的舉措，以期“重建以莊園公領(lǐng)制為基礎(chǔ)的禮儀國家”。他仿照后三條天皇設(shè)置記錄所，作為實(shí)施莊園整理令的機(jī)關(guān)，積極推進(jìn)全國莊園的整頓。記錄所的長(zhǎng)官由大納言藤原公教擔(dān)任，下設(shè)弁官負(fù)責(zé)實(shí)務(wù)，其中右中弁為藤原惟人，左少弁為源雅賴，右少弁為信西的嫡子藤原俊憲。記錄所下還設(shè)有寄人21名，負(fù)責(zé)處理莊園上的問題。
同時(shí)，手握大權(quán)的信西還向五畿七道征稅，用于重建大內(nèi)、重興御宴等，以期通過復(fù)興禮儀來恢復(fù)宮廷貴族社會(huì)秩序。保元二年（1157）十月，大內(nèi)建成，后白河天皇移駕新宮，發(fā)布三十五條新制，包括重整身份等級(jí)的奢靡禁止令、下級(jí)官員公務(wù)厲行令、京城秩序確定令等。保元三年（1158）正月，后白河天皇在皇宮內(nèi)舉辦了場(chǎng)面盛大的御宴。從長(zhǎng)元七年（1034）開始，宮廷御宴已經(jīng)中斷了120多年。此外，后白河天皇還在新宮舉辦了中斷30多年的相撲節(jié)。
為了推進(jìn)國政改革，信西需要武士的支持?！氨Ｔ畞y”后，源義朝與平清盛分別成為源氏與平氏的首領(lǐng)。源義朝一心想要依附信西，提出將自己的女兒嫁給信西之子藤原是憲。但信西見源義朝不受后白河天皇待見，不愿與其結(jié)為姻親。然而，不久后信西之子藤原成范便娶了受到后白河上皇重用的平清盛之女，與平清盛結(jié)成親家。這樣一來，信西就招致了源義朝的怨恨。
保元三年（1158）八月，后白河天皇退位，其子守仁親王踐祚，是為二條天皇（16歲）。二條天皇即位后，藤原忠通辭去關(guān)白一職，由其子藤原基實(shí)（后來的近衛(wèi)基實(shí)）接替。當(dāng)時(shí)藤原基實(shí)只有16歲，由此日本誕生了第一位少年關(guān)白。由此也可以看出，院政時(shí)期的關(guān)白已經(jīng)是徒有虛名。
“在此之前，王權(quán)內(nèi)部的對(duì)立通常都是兄弟之間的問題。但是，由于鳥羽天皇之后皇位繼承的特殊情況，后白河和二條父子之間出現(xiàn)了尖銳對(duì)立的萌芽。”前文已述及，后白河天皇只是皇太子守仁親王即位前的一個(gè)過渡。但此時(shí)后白河上皇已經(jīng)擺脫了“過渡性天皇”的地位，他仿照白河上皇與鳥羽上皇的做法，以太上天皇的身份親理政務(wù)，朝中大事依舊由信西主持。但是，二條天皇頗有英明之譽(yù)，不唯后白河上皇之命是從，政局再次發(fā)生變化。
二條天皇的支持者是其養(yǎng)母藤原得子以及與她關(guān)系密切的藤原經(jīng)宗和藤原惟方等貴族。與之相對(duì)，支持后白河上皇的貴族首領(lǐng)是其乳母的丈夫信西。藤原信賴、藤原成親等人雖然侍奉在白河上皇身邊，卻因人脈關(guān)系與藤原得子和二條天皇更為親近。藤原信賴在希望晉升近衛(wèi)大將一職時(shí)，信西將其比作安祿山，認(rèn)為“敘位、除目，國家大典。選非其人，則上違天心，下乖人情”?！叭粜刨嚾沃种买溕?，自取禍敗。”藤原信賴知道此事后，對(duì)信西一直心懷怨恨，想要伺機(jī)報(bào)復(fù)。
在這種形勢(shì)下，藤原信賴便拉攏源義朝，意圖排擠信西和平清盛。同樣是“保元之亂”中的功臣，平清盛被加官至三位，位列公卿，聲名顯赫。其子平重盛，其弟平賴盛等，也都位列朝堂。與此相對(duì)，源義朝得到的恩裳比平清盛少，一直屈居五位，對(duì)此頗為不滿。于是，藤原信賴與源義朝因共同的仇恨一拍即合。
信西在改革過程中，是有理想有決心的，但不可否認(rèn)的是，其親信都一同沾了光。其中藤原俊憲擔(dān)任大弁，藤原貞憲擔(dān)任右中弁，藤原成憲（后改名藤原成范）、藤原修憲分別受領(lǐng)遠(yuǎn)江、美濃。此外，信西一方面讓自己的兒子在后白河上皇的身旁擔(dān)任要職，另一方面又把自己的兒子送到二條天皇的身邊，成為二條天皇近臣。此舉同時(shí)引起了后白河上皇和二條天皇身邊近臣的反感，導(dǎo)致兩方都出現(xiàn)了反信西的勢(shì)力。而且，信西大刀闊斧的政治改革因觸碰了貴族的利益，遭到他們的強(qiáng)烈反對(duì)。最終以藤原信賴為中心，形成了超越原本對(duì)立關(guān)系的反信西勢(shì)力“統(tǒng)一戰(zhàn)線”。
平治元年（1159）十二月九日夜，藤原信賴與源義朝乘平清盛離開都城遠(yuǎn)赴熊野參拜之機(jī)，在信西反對(duì)者的默許下發(fā)動(dòng)軍事政變。藤原信賴首先讓源義朝率軍襲擊院御所三條殿，控制后白河上皇并將其軟禁。為了捉拿信西及其子嗣，接著火燒三條殿，并向四處逃散的人群射箭，導(dǎo)致死傷無數(shù)。信西由于事先察覺到危險(xiǎn)，幸運(yùn)地得以暫時(shí)逃脫。
與此同時(shí)，藤原信賴與源義朝聯(lián)絡(luò)二條天皇的支持者藤原惟方等人，擁立二條天皇，挾天子以令諸侯。信西一路逃到山城國原野之中，但仍然沒有擺脫武士的追擊，在絕望中自殺。信西死后首級(jí)被取下，于京都示眾。然而，藤原信賴和源義朝對(duì)于新政權(quán)并沒有任何理想和構(gòu)想，更多的只是出于怨恨。此時(shí)叛亂的中心人物中，藤原信賴（27歲）、藤原成親（22歲）以及在戰(zhàn)斗中表現(xiàn)突出的源義朝嫡子源義平（19歲）都很年輕。因此，有學(xué)者認(rèn)為，“‘平治之亂'可以稱得上是‘保元之亂'之后品嘗到了暴力滋味的青年們意氣用事的‘青年起義'”。
另一方面，平清盛在尚未參拜之際便收到政變的消息，于是火速回師京都六波羅官邸。實(shí)力相對(duì)較弱的源義朝不敢對(duì)平清盛的六波羅發(fā)動(dòng)攻擊。平清盛也沒有對(duì)挾持著后白河上皇與二條天皇的源義朝貿(mào)然行動(dòng)。最終，在經(jīng)過一段時(shí)間的對(duì)峙后，平清盛用計(jì)麻痹囂張跋扈的藤原信賴與居功自滿的源義朝，并伺機(jī)將上皇與天皇“救出”。接著前關(guān)白藤原忠通與現(xiàn)關(guān)白藤原基實(shí)父子及其眾多公卿幾乎都來到六波羅官邸拜謁。藤原信賴從負(fù)責(zé)看管上皇與天皇的藤原成親處得知上皇、天皇被救走后，驚慌失措，不知如何是好。源義朝則暴跳如雷，大罵藤原信賴是天下第一無腦之人。
二十六日，二條天皇在新內(nèi)里六波羅館頒發(fā)追討藤原信賴和源義朝的宣旨。沒有后顧之憂的平清盛于是馬上奉詔發(fā)兵，這樣以平清盛和源義朝為首的兩大武士集團(tuán)便以京都為舞臺(tái)展開了激烈的戰(zhàn)斗。最終，在戰(zhàn)斗中敗下陣來的源義朝帶上殘存士兵逃亡東國，企圖東山再起，但在途中被殺。藤原信賴看到源義朝兵敗后，知道自己將被處罰，于是投奔后白河上皇。后白河上皇雖然也替他求情，但沒有得到赦免而被處死。一直屈從于藤原信賴的藤原成親，在與其有姻親關(guān)系的平清盛嫡長(zhǎng)子平重盛的營救下，保住了性命。以上軍事政變，史稱“平治之亂”。
翌年正月，源義朝的首級(jí)于京都示眾。其長(zhǎng)子“惡源太”源義平被捕后也被斬首。源義朝年僅13歲的三子源賴朝原本也因隨父參與戰(zhàn)亂而被判處死刑。但在平清盛的繼母藤原宗子（池禪尼）的求情之下，免于一死，被流放至伊豆國。源義朝的側(cè)室常盤原所生牛若（源義經(jīng)）也一同被赦免。
“平治之亂”后，一方面后白河上皇失去了近臣集團(tuán)的核心成員，另一方面期待著二條天皇實(shí)行院政的貴族們也元?dú)獯髠?，而且圍繞政局主導(dǎo)權(quán)問題，后白河上皇和二條天皇之間的關(guān)系日趨惡化?！捌街沃畞y”同時(shí)也使武家棟梁源氏崩潰，平清盛作為唯一的武家棟梁，巧妙地斡旋于上皇和天皇之間，逐漸掌握了朝廷大權(quán)，成了最后的贏家。由此，天皇制徹底走向了沒落，代之而起的是武士專權(quán)。
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大日本史 卷之一百四十六 列傳第七十三
https://miko.org/~uraki/kuon/furu/text/dainihonsi/dns146.htm#03
大日本史 卷之一百四十八 列傳第七十五
https://miko.org/~uraki/kuon/furu/text/dainihonsi/dns148.htm#03
大日本史 卷之一百五十五 列傳第八十二
https://miko.org/~uraki/kuon/furu/text/dainihonsi/dns155.htm#01
